- 氏名
- 中井 琢（なかいたく）
- 助成実績
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スポーツチャレンジ研究助成(奨励)：第15期生
大規模ゲノムデータに基づく日本人スポーツ関連遺伝子SNPの探索
ToMMoの三世代・地域住民コホートで調査された14万人のゲノムデータを用いて、一般日本人におけるスポーツ関連遺伝子のSNP保有パターンを網羅的に決定する。被験者ひとりひとりのSNP保有パターンによる多次元圧縮解析を行い、日本人集団を細分類する。さらに、スポーツ歴などのアンケート調査や生化学的検査の結果との関連付けにより、細分類された亜集団の特徴を捉え、個別化トレーニング法の設計精度向上に繋げる。
成果報告（2022年3月）
本研究では、網羅的なゲノムデータに基づく運動能力の予測モデル構築を目的に、運動能力に関する一塩基多型（SNP）の網羅的データベースを作出することとした。研究の第一段階として、持久性運動能力における日本人の遺伝的特徴とその多様性を明らかにするために、東北メディカルメガバンク機構の大規模かつ網羅的なゲノムデータから、赤血球数・ヘマトクリット値・ヘモグロビン値に関する遺伝的特徴を同定することとした。まず、形質に対するそれぞれのSNPの相関スコアを統計処理により算出した。続いて、相関スコアの高いSNPの保有パターンに基づいたクラスタリングを行ったところ、日本人集団が二分され、集団間で赤血球数に差を認めた。本結果は、SNPの保有パターンから赤血球数の予測が可能であることを示唆している。今後、よりスポーツに関わりの深い表現型に解析対象を拡大していき、深層学習を用いた予測モデル構築を目指していく。